Nagrodę Prezydenta m.st. Warszawy w dziedzinie architektury władze samorządowe ustanowiły w 2002 roku. Zakładano wówczas, że to honorowe wyróżnienie przyznawane będzie corocznie najlepszym obiektom zrealizowanym na terenie stolicy w ciągu ostatnich 12 miesięcy. Laureatów wyłaniać miał zarząd m.st Warszawy spośród obiektów rekomendowanych mu przez kapitułę. W 2002 roku w jej skład weszli reprezentanci warszawskiego SARP-u Rafał Szczepański i Grzegorz Buczek, przedstawiciele TUP-u Andrzej Kiciński i Maciej Nowakowski, a także Wojciech Matusik, dyrektor Wydziału Planowania Przestrzennego i Architektury urzędu miasta, Jerzy Nowakowski, dyrektor Wydziału Urbanistyki i Architektury ówczesnej gminy Warszawa-Centrum oraz Małgorzata Zdanowicz, zastępca dyrektora Wydziału Planowania Przestrzennego i Architektury m.st. Warszawy. Nagrody przyznano w trzech kategoriach: za najlepszy obiekt biurowy siedzibie Agory projektu JEMS Architekci, za najlepszy obiekt usługowy ambasadzie Kanady projektu Webb Zerafa Menkes Housden, a za najlepszy obiekt mieszkalny budynkowi Oaza przy ul. Białobrzeskiej 51 autorstwa Atelier 2 Kucza-Kuczyński, Miklaszewski.
W 2005 roku próbowano powrócić do idei nagradzania najlepszych warszawskich realizacji. Laury miały być przyznawane również najlepszym uchwalonym planom zagospodarowania przestrzennego, niestety nic z tego nie wyszło. W tym roku ratusz zamierza po raz kolejny reaktywować nagrodę. Jak zapowiedział na swoim facebookowym profilu Jacek Wojciechowicz, wiceprezydent Warszawy odpowiedzialny za zadania z zakresu architektury i zagospodarowania przestrzennego, nagroda za najlepsze realizacje przyznawana będzie we współpracy ze stołecznym oddziałem SARP od tego roku. Pierwsza edycja obejmie obiekty ukończone w latach 2000-2015. W ostatnich latach poziom architektury realizowanych budynków i przestrzeni publicznych w naszym mieście jest coraz wyższy. Większe doświadczenie projektantów, zrozumienie po stronie inwestorów, oczekiwania klientów, a także nasza polityka w tym zakresie skutkują coraz piękniejszymi obiektami. Architektoniczna Nagroda Prezydenta m.st. Warszawy będzie przydzielana w kilku kategoriach: budynek publiczny, osiedle mieszkaniowe, budynek wysokościowy, przykład rewitalizacji itp. Przewidziana jest też nagroda mieszkańców – wyjaśnia Jacek Wojciechowicz. Szczegóły mają być podane już wkrótce.
